Home     Genomes     Genome Browser     Blat     Tables     PCR     Session    FAQ     Help

Value histogram for bosTau4.nestedRepeats.name   value count graph BovB 92601 ************************************************************ L2a 23360 *************** L1_BT 20715 ************* ART2A 16162 ********** L1_Art 13636 ********* L2c 13272 ********* L1MA9 13123 ********* L2b 10463 ******* MIRb 10069 ******* L1M5 8964 ****** MIR 8151 ***** L2 7348 ***** Bov-tA2 5823 **** L1MC4 5589 **** L3 5106 *** L1ME1 5000 *** HAL1 4869 *** L1ME4a 4587 *** BOV-A2 4147 *** L1M4 4138 *** BTLTR1 4060 *** L1M3 3986 *** L1MEc 3892 *** L1MC4a 3784 ** CHRL 3750 ** L1MB7 3673 ** MLT1D 3669 ** MLT1C 3652 ** L1MC1 3549 ** L1MEg 3313 ** MLT1B 3290 ** L1MC5 3214 ** MIRc 3108 ** L1MB8 2768 ** L1MB3 2743 ** L1MC3 2650 ** L1MEf 2644 ** L1ME3A 2524 ** MER21C 2441 ** L1M2 2376 ** L1ME3C 2270 * Bov-tA1 2263 * L1ME2 2210 * L1MEe 2121 * MLT1A0 2108 * MER5A 2013 * Tigger1 1977 * L1MD2 1972 * L1M4c 1948 * MLT1K 1937 * L1MCa 1840 * L1MA6 1834 * L4 1808 * ERVL-E-int 1768 * L1MEd 1767 * CHR-2B 1761 * L1MC 1696 * MLT1J 1666 * MLT1A 1636 * L1MB5 1593 * L1MD 1510 * L1MDa 1509 * L1MB1 1476 * L1ME3 1468 * MER33 1461 * MLT1H 1451 * MER5B 1420 * L1MB4 1383 * MLT1L 1358 * L1MB2 1348 * L1MA4 1331 * ARLTR2 1311 * CHR-2 1294 * Tigger1a_Art 1292 * Charlie1a 1275 * MER20 1259 * MLT1I 1222 * LTR33 1213 * L1M4b 1206 * L1MC2 1181 * L1ME2z 1103 * L1ME3B 1076 * Tigger5 1017 * MLT1F2 1011 * L1MD1 974 * L1MD3 938 * MER2B 929 * L1M6 921 * L1MA8 917 * MER52-int 911 * Bov-tA3 905 * L1ME3E 881 * Tigger7 855 * HERV16-int 846 * MER58A 844 * L1ME3F 833 * CHR-2A 829 * L1ME3D 815 * MER34A1 806 * L1M3de 804 * MER34 795 * Arthur1 791 * MLT1E2 788 * MER3 785 * MLT2B4 779 * MLT2D 778 * MLT1J2 776 * Charlie5 761   MER31-int 753   MER58B 750   LTR16C 749   Charlie7 739   ERVL-B4-int 734   LTR78 721   MLT1E1A 717   MER34A 715   Charlie1 710   (TG)n 709   MIR3 699   MLT1F 695   MER5A1 695   MLT1H2 693   MER82 671   LTR16A 669   MLT2B1 661   MER20B 648   Charlie2b 641   Charlie4a 638   Tigger2a_Art 638   L1MCc 625   MLT1F1 615   (CA)n 613   L1M7 608   Charlie2a 604   MLT1J1 603   HAL1b 593   L1MA7 579   MLT1G 556   MLT1H1 546   Tigger13a 540   (TA)n 532   MLT1G1 529   L1MA10 516   LTR50 507   L1MA4A 501   MLT1G3 500   L1M3c 497   Charlie1b 490   MLT1N2 486   L1MA5 485   MER53 479   Tigger2f 465   L1MCb 462   MER63B 457   MER115 444   MER34B-int 442   Zaphod 427   Cheshire 422   LTR16A1 421   MLT2C1 421   MER77 400   Tigger15a 394   BLACKJACK 381   BTSAT3 374   MER67C 369   MER113 366   MER57A-int 365   LTR41 362   MLT1E3 355   MamRep605 345   LTR79 332   MER21B 331   Oamar1 330   Arthur1B 328   MER68 324   MER2 323   LTR37B 323   L1MEb 318   L1ME5 317   Kanga2_a 311   MER45B 309   LTR40a 301   MER74A 300   Kanga1 300   MER63D 298   MLT2F 296   LTR33A 295   Charlie8 294   MER89 294   MER46C 282   L3b 281   MLT1J-int 277   LTR16E1 273   MER119 272   MER45C 271   MER90a 268   MLT2C2 266   MLT1E1 265   MER63C 265   MER112 265   LTR37A 258   L1MDb 255   LTR39 254   LTR16E2 248   LTR33B 241   LTR82A 238   LTR82B 233   Charlie10 231   HERVL40-int 230   LTR33A_ 224   Zaphod3 220   MER31B 220   MER67D 214   Charlie25 214   Tigger9a 208   MamRep1527 206   MLT1E 205   LTR41B 203   L1MEg1 195   MER102a 195   LTR40b 194   MLT2B2 190   Tigger9b 189   ORSL 187   Tigger6a 187   MLT1D-int 185   MER45A 178   LTR16B1 175   ERVL-int 171   MER102b 170   MER34-int 165   MARNA 165   L1MEg2 164   MLT1B-int 162   MER92B 162   L1M3d 159   LTR84b 159   MER96B 159   MER74B 157   Tigger2 155   LTR16B2 154   MLT1C-int 154   Tigger10 154   MER63A 153   MER58C 152   MER31A 152   MER91A 151   L1M3a 151   LTR85a 149   Charlie20a 147   MER91B 146   (TGGA)n 144   (TCCA)n 143   LTR16D 143   GA-rich 142   MamGypLTR1a 140   CT-rich 140   LTR83 139   FordPrefect 139   MamRep4096 139   Charlie24 138   MER66-int 137   LTR33C 134   MLT1H-int 133   MER21-int 132   Tigger12 131   MER76 128   L1PB4 127   Kanga11a 127   Charlie21a 125   MamRep137 125   MER90 123   MLT1M 123   CR1_Mam 122   MER92A 122   Helitron3Na_Mam 121   MLT1J2-int 121   MER57E2 120   LTR88b 119   Looper 119   Charlie13a 116   MER5C 115   Kanga1a 115   Charlie18a 115   LTR87 112   MLT1G1-int 112   LTR52 110   MLT1I-int 106   HERVL74-int 105   MLT1F1-int 103   LTR84a 103   BTSAT2 103   MamRep1161 102   MLT1H2-int 101   LTR81B 99   MER110 98   LTR16B 97   LTR89 96   MER67B 95   MER110A 95   ORSL-2b 95   Charlie9 93   LTR85b 93   MER113A 92   MamGypLTR1c 91   MER106B 90   MER110-int 89   MamGypLTR1b 88   Zaphod2 88   Tigger8 88   MER89-int 87   L1M3b 87   LTR85c 87   MER87 87   Tigger12c 86   L1M 86   Charlie4z 86   MER45R 85   LTR31 85   MER103 80   MamGypLTR2c 79   LTR81A 79   LTR53 78   CHR-1 78   Charlie22a 78   MER4B-int 78   MER67A 77   MER99 77   MLT1G3-int 77   MER58D 76   MLT1H1-int 76   L1MA5A 76   MLT1F-int 75   Charlie19a 75   LTR55 74   MER81 74   LTR80A 73   MLT1J1-int 72   MLT1A-int 72   L5 72   Kanga1b 71   MER97a 71   MER117 70   Kanga1d 70   LTR80B 69   BTSAT4 69   MER102c 67   LTR81C 67   L1MEa 66   Tigger12A 66   LTR52-int 64   LTR65 64   (CGGGG)n 64   MamRep38 63   MER50-int 63   MER94 62   MLT1A0-int 61   LTR86C 61   Kanga1c 61   L1M3e 60   Charlie14a 60   Charlie7a 60   MamGypLTR1d 60   MER44D 58   LTR68 58   Tigger6b 58   LTR40c 57   MER104 56   G-rich 56   MLT1-int 55   MER97b 54   MamRep434 54   MER57E1 53   MLT1K-int 53   Arthur1C 52   MERX 51   Charlie6 51   LTR73 48   LTR88c 48   Charlie23a 48   Tigger11a 48   C-rich 48   Helitron1Nb_Mam 47   Arthur1A 47   MLT2E 46   MER8 46   Helitron1Na_Mam 46   MER106A 46   MER92C 45   MER44B 45   MER57F 44   MER105 44   LTR75 44   LTR86A1 44   MLT1E2-int 43   L1M1 43   Charlie4 43   Charlie16a 42   MER74C 40   LTR16D2 39   LTR88a 38   MER68-int 38   MamGypLTR3 38   LTR86B1 38   MamGyp-int 37   MLT-int 37   MamGypLTR2b 37   LTR86A2 37   MER76-int 36   MLT1G-int 33   MER97c 33   A-rich 33   LTR16D1 32   (CCCCG)n 31   MLT1F2-int 29   HAL1-2a_MD 28   MER5C1 28   Charlie26a 27   (TGG)n 27   Charlie13b 27   FordPrefect_a 27   MER88 26   LTR45 26   ORSL-2a 26   MamGypLTR2 26   MER47B 24   T-rich 24   (TATAA)n 24   LTR90A 23   Tigger16a 23   Charlie11 23   MLT1E1A-int 23   (TAGA)n 23   Charlie15a 22   MamRep1879 21   MER83A-int 21   Tigger16b 21   Charlie17a 21   LTR86B2 20   (CCA)n 20   MER96 19   (TTATA)n 18   (TCTCTG)n 18   AmnSINE1 18   Charlie10b 18   ALINE 18   Tigger14a 18   (CCCA)n 18   (T)n 17   MER135 16   U6 16   MLT2B3 16   Charlie10a 16   (TCTA)n 16   (CGG)n 16   (CAGAGA)n 16   L1M2c 15   MER47A 15   LTR90B 15   LSU-rRNA_Hsa 14   (TATG)n 14   MER124 14   MLT1A1 14   (TGGG)n 14   (CCG)n 14   MER91C 13   (TATATG)n 13   LTR48B 12   OSSAT2 12   HAL1-3A_ME 12   (TCTG)n 12   (CCCCAG)n 12   MLT1L-int 11   MER97d 11   (TTAGGG)n 11   (CACG)n 11   Helitron2Na_Mam 11   (A)n 10   MER121 10   (CTGGGG)n 10   MADE2 10   (CATA)n 10   (TAG)n 9   (CATATA)n 9   L1M2a 9   MLT1E1-int 9   LTR48 9   (AGGTG)n 8   MER57-int 8   7SK 7   MER95 7   (GGGTG)n 7   MamRep1894 7   (CACCAT)n 7   MamRep564 7   MER127 7   MER83B-int 6   SSU-rRNA_Hsa 6   MLT1E-int 6   LFSINE_Vert 5   MER70-int 5   (TTCA)n 5   (TGAA)n 5   HUERS-P3b-int 5   (TTA)n 5   Tigger2a_Car 5   (TGAG)n 5   (CAGT)n 5   MamSINE1 4   Ricksha_c 4   UCON28a 4   BTSAT6 4   (CTA)n 4   MLT1M-int 4   (CAGTT)n 4   tRNA-Glu-GAG_ 4   (CACCC)n 4   (CCCTAA)n 4   (GTGTG)n 4   LTR45C 4   (CTCA)n 4   (CAGA)n 4   (CGTG)n 4   MER65-int 3   MER44A 3   MER51-int 3   (CTATA)n 3   polypurine 3   (CACTA)n 3   (GGCTG)n 3   tRNA-Glu-GAA 3   (CTG)n 3   (CAGGG)n 3   Eulor5A 3   (CCGG)n 3   (CAT)n 3   UCON4 3   Eulor8 3   MamRep488 3   (CCTA)n 3   (TTAA)n 3   UCON27 2   (CAGG)n 2   (CCTG)n 2   AmnSINE2 2   (TC)n 2   Eulor6B 2   (ATG)n 2   MER134 2   (CACTC)n 2   (CCAA)n 2   MLT1E3-int 2   (GA)n 2   (GGATG)n 2   MER66C 2   (CACAC)n 2   (AACTG)n 2   Eulor3 2   Tigger2b_Pri 2   (TATAG)n 2   (CCCCAA)n 2   (CCCTG)n 2   UCON29 2   MER54B 2   (CATG)n 2   (TTGG)n 2   (CTCGG)n 2   (CACAA)n 2   MER125 2   (CAGCC)n 2   MER129 2   MLT2B5 2   (AGATG)n 2   (TTGTG)n 2   MLT1N2-int 2   (GGA)n 2   OSSAT1 2   (TTTA)n 1   UCON11 1   MER57D 1   tRNA-Tyr-TAC 1   (CAACT)n 1   (CGAGG)n 1   (ATGTG)n 1   Eulor6C 1   (CCCG)n 1   (TCC)n 1   (CAATC)n 1   UCON17 1   (CAACC)n 1   (CAGAC)n 1   (CACTG)n 1   UCON9 1   (CATCC)n 1   MER136 1   (CTACT)n 1   (CAATT)n 1   (TTTTTA)n 1   tRNA-Glu-GAG 1   (CAGGA)n 1   (CACAG)n 1   (CAAAA)n 1   MER44C 1   CheshMITE 1   LTR64 1   Eulor9C 1   U4 1   (TTTC)n 1   (CAGAT)n 1   (CTCTG)n 1   tRNA-Leu-CTY 1   HAL1N1_MD 1   UCON26 1   UCON8 1   (GGAA)n 1   (GCCTG)n 1   tRNA-Thr-ACA 1   (TAGG)n 1   (CAGC)n 1   Eulor6D 1   (CACAT)n 1   (TTG)n 1   (TAAA)n 1   (TCG)n 1   MER133A 1   (GAGTG)n 1   (CGA)n 1   tRNA-Gly-GGA 1   UCON14 1   MER133B 1   UCON7 1   (TTGGGG)n 1   UCON6 1   UCON20 1   MER57C2 1   SUBTEL_sa 1   (CAG)n 1   Eulor11 1   MER70B 1   (ATGGTG)n 1