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  Schema for gbMiscDiff
  Database: bosTau4    Primary Table: gbMiscDiff    Row Count: 142,899
Format description: misc_difference annotations from Genbank
fieldexampleSQL type info description
acc BC000003varchar(12) values Genbank accession
mrnaStart 511int range start within mRNA
mrnaEnd 511int range end within mRNA
notes 1 base in cDNA is not found...longtext values notes
gene  varchar(255) values gene name
replacement  varchar(255) values replace

  Connected Tables and Joining Fields
        bosTau4.all_est.qName (via gbMiscDiff.acc)
      bosTau4.all_mrna.qName (via gbMiscDiff.acc)
      bosTau4.gbCdnaInfo.acc (via gbMiscDiff.acc)
      bosTau4.gbWarn.acc (via gbMiscDiff.acc)
      bosTau4.refGene.name (via gbMiscDiff.acc)
      bosTau4.refSeqAli.qName (via gbMiscDiff.acc)
      bosTau4.xenoMrna.qName (via gbMiscDiff.acc)

  Sample Rows
BC0000035115111 base in cDNA is not found in the human genome. The chimpanzee genome agrees with the human genomic sequence and not the cDNA.
BC000003753753'T' in cDNA is 'G' in the human genome.  The chimpanzee genome agrees with the human genomic sequence and not the cDNA.
BC0000039249252 bases at the 3' end do not align to the human genome.
BC0000344804812 bases in the human genome, GG, are not found in cDNA.
BC00003416091625polyA tail: 17 bases do not align to the human genome.
BC0000612727'G' in cDNA is 'T' in the human genome.  The chimpanzee genome agrees with the cDNA sequence, suggesting that this difference is ...
BC00006110511051'G' in cDNA is 'A' in the human genome.  The chimpanzee genome agrees with the human genomic sequence and not the cDNA.
BC00006115461546'C' in cDNA is 'G' in the human genome.
BC00006125282528'C' in cDNA is 'T' in the human genome.
BC000061256325641 base in the human genome, C, is not found in cDNA.  The chimpanzee genome agrees with the human genomic sequence and not the c ...

Note: all start coordinates in our database are 0-based, not 1-based. See explanation here.