当センターのシーケンサーのパフォーマンス


HiSeq2500	NextSeq500	MiSeq

	HiSeq2500	NextSeq500	MiSeq
リード長　Single read: SR 　Paired-end read: PE	SR50 SR100 PE200	Mid-outputの場合　PE150 　PE300 High-outputの場合　SR75 　PE150 　PE300	PE150 PE600
１レーンもしくは１ランあたりの最大出力リード数	2 x 150M reads/lane	Mid-outputの場合　2 x 104M reads/run High-outputの場合　2 x 320M reads/run	2 x 20M reads/run
１レーンもしくは１ランあたりの出力データ量	7.5～30Gb/lane	Mid-outputの場合　15.2～31.2Gb/run High-outputの場合　24～96Gb/run	3.04～12Gb/run

申請書作成に当たっての注意点

これまでに審査員から指摘される頻度が多かった内容です。

・NGSにより目的が達成できるのかどうかの検討が不十分
　( 例えば、RNA-seqの比較だけで注目する形質の原因遺伝子を見つける、というような申請は
　説明不足になりがちです。 )

・サンプル準備に対する計画性や妥当性

・非モデル生物等のリファレンスゲノムが適用されにくい場合の解析方針
　( 例えば、変異解析を行う場合にはデータをどのように扱うのか、解釈するのかを十分に
　説明する必要があります。 )

当センターが提案している1サンプル当たりの解析規模です。

これまでに採択された１課題当たりのリード数の分布です。