現在、Radish Genome Databaseのサーバーがダウンしています。誠に恐れ入りますが、復旧まで今しばらくお待ちくださいますようよろしくお願い致します。

農学新時代 生物資源ゲノム解析センター 新領域の創出へ

東京農業大学生物資源ゲノム解析センターは、文部科学省の平成20年度私立大学戦略的研究基盤形成支援事業として採択された「革新的ゲノム解析情報を用いた生物資源ゲノム解析と農学新領域の創出」プロジェクトの一環として、東京農業大学の全学組織として新設されました。生物資源ゲノム解析センターには、イルミナ社のゲノム解析装置が設置され、装置のオペレーターならびに情報解析や個別テーマの研究に関わる研究員が常勤スタッフとして活動しています。5年間のプロジェクトの成果をもとに、あらたに平成25年度より「生命科学と情報科学の融合による農学研究の拠点形成」をテーマとしたプロジェクトが採択され、本学におけるゲノム研究の中核として機能しています。
さらに、本センターは平成25年度より共同利用・共同研究拠点「生物資源ゲノム解析拠点」として文部科学省より認定をうけました。本拠点は、学外の専門家を含む運営委員会のもと、次世代シーケンサーをもちいた農学分野を中心とする新しい研究領域の開拓をめざし、広く学外の研究者が本センターを利用し、共同研究を推進することを目的としています。そして、1期目の実績をもとに、平成31年度より、本拠点事業も2期目に入りました。

近年では、次世代シーケンサーを使用した解析も多様化しています。ゲノムシーケンス、RNA-seq、ChIP-seq、repli-seq、TSS-seq、メチローム、メタゲノム解析など、またリシーケンスやde novo解析など様々です。当センターでは、これらの解析に対応するためイルミナ社のシーケンサーを所有し、高い汎用性を伴うNextSeq 1000、NextSeq 500、リード長に優位があるMiSeqとそれぞれの特徴を生かし使用しています。また、これらの装置から得られるデータ解析のためのサーバー群として、総メモリ容量 約5TB、総ディスク容量 約1PBのシステムを運用しています。


新着情報

2022.12. 2
当センターが主催するNGRCセミナー2022を開催します。第3回は、2022年12月16日(事前参加申込2022月12月14日まで)です。詳細

2022.11.11
生物資源ゲノム解析拠点(文部科学省「特色ある共同利用・共同研究拠点」)の2期目の活動について、中間評価を受けS評価を頂きました。詳細

2022.10.21
当センターが主催するNGRCセミナー2022を開催します。第2回は、2022年11月4日(事前参加申込2022月11月2日まで)です。詳細

2022.10.18
東京大学・井澤教授らとの共同研究。「日本のモウソウチクの由来に関する解析」が日本育種学会 第142回講演会において、優秀発表賞を受賞しました。詳細

2022.10.12
当センターが主催するNGRCセミナー2022を開催します。第1回は、2022年10月28日(事前参加申込2022月10月26日まで)です。詳細

2022. 9.22
山梨大学・榎助教らとの共同研究。ブドウ樹内マイクロフローラについて、品種、栽培地域、成育ステージを対象に比較した論文がScientific Reportsに掲載されました。詳細

2022. 9. 6
本学 バイオサイエンス学科 小川英彦教授らの研究成果。Cdx2遺伝子がマウス胚盤胞における壁栄養外胚葉の分化と機能制御に関わっていることを明らかにした論文がFrontiers in Cell and Developmental Biologyに掲載されました。詳細

2022. 7.14
生物資源ゲノム解析拠点の2022年度(後期)共同研究課題公募を開始しました。(締切2022年8月23日)詳細

2022. 6.24
本学 バイオサイエンス学科 太治輝昭教授らの研究成果。シロイヌナズナの浸透圧耐性に重要な役割を果たす遺伝子を明らかにした論文がfrontiers in Plant Scienceに掲載されました。詳細

2022. 6.13
東京大学・菊池教授および細谷助教らとの共同研究。トラフグの性決定領域を特徴付けることに成功した論文が米国科学アカデミー紀要(Proceedings of the National Academy of Sciences: PNAS)に掲載されました。詳細

2022. 5.14
東北大学・経塚教授らとの共同研究。穂の発達に関わる調節因子を直接的に制御する転写因子を明らかにした論文がPlant Physiologyに掲載されました。詳細

2022. 4.28
本学 動物科学科 岩田尚孝教授らの研究成果。ウシ卵管液中のmiR-17-5pは胚発生に及ぼす影響を調査した論文がMolecular and Cellular Endocrinologyに掲載されました。詳細

2022. 4. 8
東京大学、生理学研究所、奈良県立医科大学を中心とした研究チームによる研究成果。試験管内配偶子再構築系をラットで初めて確立し、不妊ラットへの移植実験による精子誘導及び産仔に成功した論文がScienceに掲載されました。詳細

2022. 3.22
本学 バイオサイエンス学科 太治輝昭教授らの研究成果。MKP1がシロイヌナズナの浸透圧耐性において重要な役割を果たすことを調査した論文がPlant Physiologyに掲載されました。詳細

2022. 1.20
本学 分子生命化学科 下村健司准教授らの研究成果。ヨツモンマメゾウムシの化学感覚関連遺伝子を特定するために触覚のトランスクリプトーム解析を行った論文がPLoS Oneに掲載されました。詳細

2022. 1.12
県立広島大学・福永教授らとの共同研究。雑穀・アワの実験系統作成と形質の多様化や分布拡大等の作物進化に関わる候補遺伝子を同定した論文がScientific Reportsに掲載されました。詳細

2021.12. 9
生物資源ゲノム解析拠点の2022年度(前期)共同研究課題公募を開始しました。(締切2022年1月31日)詳細

2021.11.26
東京農業大学・坂田教授、埼玉大学・竹澤教授らとの共同研究。植物が水環境を感知する仕組みを解明した論文がCurrent Biologyに掲載されました。詳細

2021.11.17
豊橋技術科学大学・広瀬助教らとの共同研究。ヘテロシスト形成をおこなうシアノバクテリア28株を含む全31株のゲノム解読と系統解析に成功した論文がDNA Researchに掲載されました。詳細

2021.11.15
当センターが主催するNGRCセミナー2021を開催します。第6回は、2021年12月17日(事前参加申込2021月12月15日まで)です。詳細

2021.11. 9
岡山大学・宮竹教授らとの共同研究。コクヌストモドキが天敵から身を守るために行う死んだふりに関してゲノム情報から特長付けることに成功した論文がScientific Reportsに掲載されました。詳細

2021.10.29
当センターが主催するNGRCセミナー2021を開催します。第5回は、2021年11月12日(事前参加申込2021月11月10日まで)です。詳細

2021.10.15
岡山大学・山本准教授らとの共同研究。暑熱条件下でリポ多糖を用いて培養した牛子宮内膜細胞の遺伝子発現を調査した論文がJournal of Cellular Physiologyに掲載されました。詳細

2021.10.11
横浜市立大学・吉田助教らとの共同研究。ウキクサの栄養繁殖ステージと生殖繁殖ステージの発達変化について特徴付けした論文がfrontiers in Plant Scienceに掲載されました。詳細

2021.10. 8
当センターが主催するNGRCセミナー2021を開催します。第4回は、2021年10月22日(事前参加申込2021月10月20日まで)です。詳細

2021. 9.28
北海道大学・川原准教授らとの共同研究成果。In vitro培養法を用いてウシの着床前発生過程におけるEpi細胞とPrE細胞の特性およびTE細胞の遺伝子発現を調査した論文がThe FASEB Journalに掲載されました。詳細

2021. 9.21
当センターが主催するNGRCセミナー2021を開催します。第3回は、2021年10月8日(事前参加申込2021月10月6日まで)です。詳細

2021. 9.21
当センターが主催するNGRCセミナー2021を開催します。第2回は、2021年9月30日(事前参加申込2021月9月28日まで)です。詳細

2021. 8.16
横浜市立大学・田所助教らとの共同研究。気道の腹側と背側の挙動を明らかにするために気道上皮の基底細胞を調査した論文がBiology Openに掲載されました。詳細

2021. 8. 9
本学 食品安全健康学科 岩槻健教授らの研究成果。ニューロゲニン3 (Ngn3)-GFPトランスジェニックマウスを使用してin vitro 膵管培養システムを開発し、Ngn3陽性細胞が膵管から出現するかどうか調査した論文がInternational Journal of Molecular Sciencesに掲載されました。詳細

2021. 7.24
本学 食品安全健康学科 岩槻健教授らの研究成果。サルの腸オルガノイドにおけるIL-4やIL-13による刺激に対して腸上皮の遺伝子発現と細胞分化の変化を調査した論文がInternational Journal of Molecular Sciencesに掲載されました。詳細

2021. 7.23
本学 食品安全健康学科 岩槻健教授らの研究成果。マウス小腸におけるガスダーミンCの発現亢進と寄生虫による2型免疫誘導による腸細胞死との関連を調査した論文が米国科学アカデミー紀要(Proceedings of the National Academy of Sciences: PNAS)に掲載されました。詳細

2021. 7.22
当センターが主催するNGRCセミナー2021を開催します。第1回は、2021年8月6日(事前参加申込2021月8月4日まで)です。詳細

2021. 7.12
本学 動物科学科 岩田尚孝教授らの研究成果。ウシ卵母細胞の成長に対するドコサヘキサエン酸(DHA)の影響を調査した論文がReproductive Medicine and Biologyに掲載されました。詳細

2021. 6.29
山口大学・執行教授らとの共同研究。タマネギの遺伝子情報に基づいた高密度連鎖地図とマーカー作製に関する論文がBMC Genomicsに発表されました。詳細

2021. 6.28
生物資源ゲノム解析拠点の2021年度(後期)共同研究課題公募を開始しました。(締切2021年8月2日)詳細

2021. 6.23
株式会社北隆館出版の「アグリバイオ 2021年7月号」(2021年6月発行)に当センターの活動を紹介する記事が掲載されました。詳細

2021. 6. 1
長野県野菜花き試験場 関研究員らとの共同研究。フザリウム病害耐性を示すレタスのDNAマーカーに関する研究論文がEuphyticaに掲載されました。詳細

Illumina NextSeq 1000
Illumina NextSeq 1000