農学新時代 生物資源ゲノム解析センター 新領域の創出へ

東京農業大学生物資源ゲノム解析センターは、文部科学省の平成20年度私立大学戦略的研究基盤形成支援事業として採択された「革新的ゲノム解析情報を用いた生物資源ゲノム解析と農学新領域の創出」プロジェクトの一環として、東京農業大学の全学組織として新設されました。生物資源ゲノム解析センターには、イルミナ社のゲノム解析装置が設置され、装置のオペレーターならびに情報解析や個別テーマの研究に関わる研究員が常勤スタッフとして活動しています。5年間のプロジェクトの成果をもとに、あらたに平成25年度より「生命科学と情報科学の融合による農学研究の拠点形成」をテーマとしたプロジェクトが採択され、本学におけるゲノム研究の中核として機能しています。
さらに、本センターは平成25年度より共同利用・共同研究拠点「生物資源ゲノム解析拠点」として文部科学省より認定をうけました。本拠点は、学外の専門家を含む運営委員会のもと、次世代シーケンサーをもちいた農学分野を中心とする新しい研究領域の開拓をめざし、広く学外の研究者が本センターを利用し、共同研究を推進することを目的としています。そして、1期目の実績をもとに、平成31年度より、本拠点事業も2期目に入りました。

近年では、次世代シーケンサーを使用した解析も多様化しています。ゲノムシーケンス、RNA-seq、ChIP-seq、repli-seq、TSS-seq、メチローム、メタゲノム解析など、またリシーケンスやde novo解析など様々です。当センターでは、これらの解析に対応するためイルミナ社のシーケンサーを所有し、大規模解析にHiSeq 2500、リード長に優位があるMiSeq、柔軟かつ高速に対応できるNextSeq 500とそれぞれの特徴を生かし使用しています。また、これらの装置から得られるデータ解析のためのサーバー群として、総メモリ容量 約5TB、総ディスク容量 約1PBのシステムを運用しています。


新着情報

2020. 8. 3
2020年度(後期) 生物資源ゲノム解析拠点の共同研究課題公募を開始しました。(締切2020年8月31日)詳細

2020. 6.23
生物資源開発学科 和久井健司教授らの研究成果。カブの雄性不稔性に関与するBrEMS1遺伝子に関する論文が、Molecular Breedingに掲載されました。詳細

2020. 6. 3
香川大学・市村教授らとの共同研究。シロイヌナズナの植物病原細菌に対する免疫受容体遺伝子とRNA品質管理による制御との関係性を示す研究論文がPlant and Cell Physiologyに掲載されました。詳細

2020. 4. 9
岐阜大学・小林准教授らとの共同研究。シロイヌナズナのアルミニウムおよびプロトン耐性の制御関連遺伝子に関する研究論文がfrontiers in Plant Scienceに掲載されました。詳細

2020. 2. 1
長野県野菜花き試験場 ・関研究員らとの共同研究。玉レタスのTCP転写因子に関する研究論文がHorticulture Researchに掲載されました。詳細

2019.12.20
2020年度(前期) 生物資源ゲノム解析拠点の共同研究課題公募を開始しました。(締切2020年2月3日)詳細

2019.12.12
奈良県立医科大学・小林講師らとの共同研究。霊長類および齧歯類のDNAメチローム比較解析による種特異的なゲノム刷り込み機構の成立機序解明に関する研究論文がNature Communicationsに掲載されました。詳細

2019.11.20
京都大学・増田准教授らとの共同研究。抗ガン活性フラボノイドによる遺伝子発現制御機構に関する研究論文がiScienceに掲載されました。詳細

2019.11.11
信州大学・高谷助教らとの共同研究。肉用鶏と卵用鶏の骨格筋芽細胞における遺伝子発現を比較解析した論文がScientific Reprotsに掲載されました。詳細

2019. 9.30
岡山大学・宮竹教授らとの共同研究。コクヌストモドキの死んだふりを制御する遺伝子群を解明した論文がScientific Reprotsに掲載されました。詳細

2019. 9. 4
京都大学・上村教授らとの共同研究。ショウジョウバエを用いた、栄養に柔軟に適応し成長するシステムの解明に関する論文がCell Reportsに掲載されました。詳細

2019. 7.16
生物資源ゲノム解析拠点の共同研究課題公募を開始しました。(締切8月30日)詳細

2019. 4. 2
生物資源ゲノム解析センターが生物資源ゲノム解析拠点として文部科学大臣より共同利用・共同研究拠点の認定を受けました。今後、共同研究の公募などを行っていきます。

Illumina HiSeq 2500
Illumina HiSeq 2500