当センターのシーケンサーの紹介


ショートリードタイプ

NextSeq 1000

NextSeq 500

MiSeq

NextSeq 1000 NextSeq 500 MiSeq
リード長
 　Single read: SR
　Paired-end read: PE 		PE100
PE200
PE300
PE600 		Mid-outputの場合
　PE150
　PE300
High-outputの場合
　SR75
　PE150
　PE300 		PE150
PE600
１ランあたりの
最大出力リード数 		2 x 300～400M reads/run Mid-outputの場合
　2 x 104M reads/run
High-outputの場合
　2 x 320M reads/run 		2 x 20M reads/run
１ランあたりの
出力データ量 		10～240Gb/run Mid-outputの場合
　15.2～31.2Gb/run
High-outputの場合
　24～96Gb/run 		3.04～12Gb/run

ロングリードタイプ

MinION Mk1B

PromethION 2 Solo

MinION Mk1B PromethION 2 Solo
リード長
 		数kb～数百kb 数kb～数百kb
ligation sequencing kit
N50長 		10 kb～50kb 10 kb～50kb
１ランあたりの
出力リード数 		～2M reads/run ～5M reads/run
１ランあたりの
出力データ量 		～25Gb/run ～100 Gb/run

※ サンプルのクオリティに依存します。